Прототип это схематическое изображение компоновки веб-сайта, которое показывает местонахождение тех или иных блоков, деталей интерфейса, положение текстов, картинок, и многое другое. Проще понять наглядно:
Остальное по запросу. Прототипы делаются в программе Axure RP